Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lsm12Q9D0R8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms