Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc47Q9D024 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc47Q9D024 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc47Q9D024 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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