Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab3bQ9CZT8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3bQ9CZT8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms