Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis18aQ9CZJ6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis18aQ9CZJ6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mis18aQ9CZJ6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis18aQ9CZJ6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis18aQ9CZJ6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis18aQ9CZJ6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis18aQ9CZJ6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis18aQ9CZJ6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mis18aQ9CZJ6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Mis18aQ9CZJ6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis18aQ9CZJ6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis18aQ9CZJ6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis18aQ9CZJ6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis18aQ9CZJ6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mis18aQ9CZJ6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis18aQ9CZJ6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis18aQ9CZJ6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis18aQ9CZJ6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis18aQ9CZJ6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis18aQ9CZJ6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis18aQ9CZJ6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis18aQ9CZJ6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mis18aQ9CZJ6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms