Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nsfl1cQ9CZ44 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms