Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rrs1Q9CYH6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rrs1Q9CYH6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms