Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup37Q9CWU9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup37Q9CWU9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup37Q9CWU9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup37Q9CWU9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup37Q9CWU9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup37Q9CWU9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup37Q9CWU9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup37Q9CWU9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup37Q9CWU9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nup37Q9CWU9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nup37Q9CWU9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nup37Q9CWU9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nup37Q9CWU9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms