Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fcf1Q9CTH6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fcf1Q9CTH6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms