Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRW3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRW3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRW3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9CRW3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRW3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRW3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRW3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRW3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRW3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CRW3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms