Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CRC3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CRC3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q9CRC3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CRC3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CRC3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CRC3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CRC3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CRC3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CRC3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q9CRC3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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