Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc5Q9CRA8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc5Q9CRA8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc5Q9CRA8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc5Q9CRA8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Exosc5Q9CRA8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc5Q9CRA8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms