Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Msmo1Q9CRA4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms