Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR27

Washc3, WASH complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc3Q9CR27 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Washc3Q9CR27 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Washc3Q9CR27 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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