Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4931417E11RikQ9CR05 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4931417E11RikQ9CR05 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms