Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg12Q9CQY1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg12Q9CQY1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms