Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ifitm3Q9CQW9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifitm3Q9CQW9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms