Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PompQ9CQT5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PompQ9CQT5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms