Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rwdd1Q9CQK7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rwdd1Q9CQK7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rwdd1Q9CQK7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms