Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rab5aQ9CQD1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab5aQ9CQD1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab5aQ9CQD1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab5aQ9CQD1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rab5aQ9CQD1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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