Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nudcd2Q9CQ48 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd2Q9CQ48 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms