Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921530L21RikQ9CQ47 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4921530L21RikQ9CQ47 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4921530L21RikQ9CQ47 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4921530L21RikQ9CQ47 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4921530L21RikQ9CQ47 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4921530L21RikQ9CQ47 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4921530L21RikQ9CQ47 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921530L21RikQ9CQ47 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921530L21RikQ9CQ47 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms