Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc198Q9CPZ1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc198Q9CPZ1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc198Q9CPZ1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc198Q9CPZ1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc198Q9CPZ1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc198Q9CPZ1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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