Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930519G04RikQ9CPT7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930519G04RikQ9CPT7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms