Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12aQ99PQ1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim12aQ99PQ1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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