Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim26Q99PN3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim26Q99PN3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms