Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ubxn6Q99PL6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ubxn6Q99PL6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms