Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NsmfQ99NF2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NsmfQ99NF2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms