Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vgll1Q99NC0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vgll1Q99NC0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms