Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mrpl43Q99N89 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms