Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SrrtQ99MR6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SrrtQ99MR6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms