Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1b4Q99ME6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atp1b4Q99ME6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atp1b4Q99ME6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms