Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnps1Q99M28 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnps1Q99M28 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms