Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmp1Q99KU0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmp1Q99KU0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms