Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Me2Q99KE1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Me2Q99KE1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Me2Q99KE1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Me2Q99KE1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Me2Q99KE1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Me2Q99KE1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Me2Q99KE1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms