Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Klhl22Q99JN2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms