Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ddb2Q99J79 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddb2Q99J79 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms