Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Def8Q99J78 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms