Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tspan1Q99J59 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tspan1Q99J59 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms