Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cldn16Q925N4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Cldn16Q925N4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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