Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Rtn4ip1Q924D0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms