Protein–RNA interactions for Protein: Q923K4

Gtpbp3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp3Q923K4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtpbp3Q923K4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp3Q923K4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp3Q923K4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp3Q923K4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtpbp3Q923K4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Gtpbp3Q923K4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Gtpbp3Q923K4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Gtpbp3Q923K4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Gtpbp3Q923K4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp3Q923K4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp3Q923K4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp3Q923K4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Gtpbp3Q923K4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp3Q923K4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Gtpbp3Q923K4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp3Q923K4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Gtpbp3Q923K4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtpbp3Q923K4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Gtpbp3Q923K4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Gtpbp3Q923K4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Gtpbp3Q923K4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Gtpbp3Q923K4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Gtpbp3Q923K4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Gtpbp3Q923K4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Gtpbp3Q923K4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gtpbp3Q923K4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms