Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sf3b3Q921M3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sf3b3Q921M3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms