Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chrna2Q91X60 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chrna2Q91X60 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms