Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEH2

Ciz1, CDKN1A-interacting zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciz1Q8VEH2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ciz1Q8VEH2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ciz1Q8VEH2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms