Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE42

Ankrd49, Ankyrin repeat domain-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd49Q8VE42 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ankrd49Q8VE42 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ankrd49Q8VE42 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms