Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc58Q8R3Q6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms