Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mterf3Q8R3J4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms