Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2E2

Vmn1r35, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r35Q8R2E2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r35Q8R2E2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r35Q8R2E2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms