Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx19Q8R1Q0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx19Q8R1Q0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms