Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A0

Gtf2f2, General transcription factor IIF subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f2Q8R0A0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf2f2Q8R0A0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2f2Q8R0A0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms